Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms