Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms