Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms