Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms