Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD27Q96NW4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms