Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COG8Q96MW5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms