Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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