Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms