Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms