Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms