Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms