Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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