Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FAT3Q8TDW7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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