Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4Q8IY92 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms