Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms