Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms