Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PREX2Q70Z35 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PREX2Q70Z35 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms