Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00575Q6W349 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00575Q6W349 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00575Q6W349 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00575Q6W349 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00575Q6W349 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00575Q6W349 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms