Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms