Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms