Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms