Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms