Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
LDLRAP1Q5SW96 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms