Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms