Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms