Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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