Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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