Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TLR1Q15399 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TLR1Q15399 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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