Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME4Q14997 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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