Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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RAB39AQ14964 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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RAB39AQ14964 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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RAB39AQ14964 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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RAB39AQ14964 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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