Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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