Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
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