Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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