Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PRPF4BQ13523 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PRPF4BQ13523 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PRPF4BQ13523 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PRPF4BQ13523 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PRPF4BQ13523 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PRPF4BQ13523 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PRPF4BQ13523 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PRPF4BQ13523 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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PRPF4BQ13523 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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