Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP140Q13342 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP140Q13342 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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