Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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