Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATMQ13315 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATMQ13315 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATMQ13315 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATMQ13315 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATMQ13315 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATMQ13315 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATMQ13315 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATMQ13315 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATMQ13315 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATMQ13315 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATMQ13315 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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