Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
TRIM32Q13049 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms