Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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