Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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FOXC1Q12948 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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FOXC1Q12948 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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FOXC1Q12948 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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FOXC1Q12948 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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FOXC1Q12948 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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FOXC1Q12948 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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FOXC1Q12948 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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FOXC1Q12948 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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FOXC1Q12948 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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FOXC1Q12948 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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