Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms