Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms