Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms