Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms