Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms