Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRB1P82279 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRB1P82279 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRB1P82279 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRB1P82279 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CRB1P82279 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRB1P82279 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRB1P82279 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRB1P82279 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRB1P82279 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRB1P82279 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRB1P82279 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRB1P82279 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRB1P82279 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB1P82279 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB1P82279 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB1P82279 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB1P82279 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB1P82279 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB1P82279 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB1P82279 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB1P82279 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB1P82279 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB1P82279 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB1P82279 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB1P82279 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB1P82279 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB1P82279 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB1P82279 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB1P82279 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB1P82279 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRB1P82279 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRB1P82279 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRB1P82279 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRB1P82279 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRB1P82279 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRB1P82279 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CRB1P82279 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRB1P82279 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRB1P82279 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRB1P82279 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRB1P82279 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRB1P82279 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRB1P82279 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRB1P82279 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRB1P82279 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRB1P82279 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRB1P82279 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CRB1P82279 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRB1P82279 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRB1P82279 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRB1P82279 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRB1P82279 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRB1P82279 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRB1P82279 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRB1P82279 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRB1P82279 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRB1P82279 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRB1P82279 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRB1P82279 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CRB1P82279 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB1P82279 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRB1P82279 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRB1P82279 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRB1P82279 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRB1P82279 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRB1P82279 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRB1P82279 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRB1P82279 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms