Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL8P80075 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL8P80075 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL8P80075 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL8P80075 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL8P80075 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL8P80075 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL8P80075 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL8P80075 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL8P80075 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL8P80075 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms