Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP1P63208 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP1P63208 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms