Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCS1P62166 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCS1P62166 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCS1P62166 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms