Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms